Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TCF23Q7RTU1 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms