Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SMARCD3Q6STE5 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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