Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WSCD1Q658N2 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms