Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDZK1Q5T2W1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms