Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TDRD12Q587J7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms