Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KNOP1Q1ED39 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KNOP1Q1ED39 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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