Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP2B3Q16720 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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