Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DDB1Q16531 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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