Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK4Q16099 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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