Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms