Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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SYCP1Q15431 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYCP1Q15431 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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