Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 FGA-203ENST00000622532 1130 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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LAPTM4AQ15012 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LAPTM4AQ15012 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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