Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
COL19A1Q14993 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms