Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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EBI3Q14213 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EBI3Q14213 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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