Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCNIQ14094 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms