Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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