Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
IKZF1Q13422 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms