Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AC138749.1-201ENST00000567652 2472 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 PAK1-202ENST00000356341 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ADCY5-201ENST00000309879 2841 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 SIRPG-202ENST00000303415 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 SIRPG-204ENST00000381580 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 MTHFR-205ENST00000376592 8378 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AOC1-207ENST00000493429 3135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ATP2A1-201ENST00000357084 3532 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 CR2-202ENST00000367058 4063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 SEC24B-203ENST00000504968 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 DCAKD-203ENST00000452796 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 RHOH-221ENST00000615577 2227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 RHOH-223ENST00000619474 2230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 SUGP1-201ENST00000247001 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 C1S-221ENST00000617865 2844 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ACSM5-201ENST00000331849 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ANKRD34B-201ENST00000338682 3938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 LINC01122-207ENST00000452840 4077 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ULK4-201ENST00000301831 4613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 GDPD2-205ENST00000538649 2067 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 CIZ1-225ENST00000538431 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ACBD5-203ENST00000375901 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
UBE2V1Q13404 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms