Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALCOCO2Q13137 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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