Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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GRIK2Q13002 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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GRIK2Q13002 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
GRIK2Q13002 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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