Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FOXF2Q12947 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FOXF2Q12947 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXF2Q12947 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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