Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC8Q09428 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms