Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms