Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOX4Q06945 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms