Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SH3BP2P78314 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2P78314 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms