Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms