Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HERVK_113P62684 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HERVK_113P62684 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms