Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BACE1P56817 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BACE1P56817 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BACE1P56817 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BACE1P56817 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BACE1P56817 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BACE1P56817 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
BACE1P56817 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BACE1P56817 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BACE1P56817 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms