Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

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Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 LINC01892-202ENST00000583985 540 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AC091614.1-201ENST00000606898 879 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AL353770.4-202ENST00000621296 1126 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 BX005040.1-201ENST00000622281 1126 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 CBWD3-206ENST00000478048 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EMP3P54852 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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EMP3P54852 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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EMP3P54852 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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EMP3P54852 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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EMP3P54852 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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EMP3P54852 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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EMP3P54852 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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EMP3P54852 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EMP3P54852 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EMP3P54852 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EMP3P54852 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EMP3P54852 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EMP3P54852 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EMP3P54852 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EMP3P54852 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EMP3P54852 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EMP3P54852 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EMP3P54852 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EMP3P54852 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EMP3P54852 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EMP3P54852 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EMP3P54852 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EMP3P54852 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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