Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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PGGT1BP53609 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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PGGT1BP53609 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PGGT1BP53609 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PGGT1BP53609 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PGGT1BP53609 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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