Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CSNK1DP48730 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CSNK1DP48730 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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