Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABRB2P47870 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms