Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL5P42830 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms