Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGAEP38570 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms