Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA7P31268 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms