Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA1P29973 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms