Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASP1P29466 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms