Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms