Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HLA-DMAP28067 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms