Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms