Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKCHP24723 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRKCHP24723 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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