Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1P21675 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1P21675 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1P21675 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1P21675 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1P21675 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1P21675 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1P21675 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1P21675 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1P21675 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TAF1P21675 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TAF1P21675 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TAF1P21675 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TAF1P21675 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms