Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL3P19876 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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