Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTLA4P16410 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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