Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ODC1P11926 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ODC1P11926 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms