Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LAMC1P11047 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms