Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFNB1P01574 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms