Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ZBED1O96006 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ZBED1O96006 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ZBED1O96006 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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ZBED1O96006 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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ZBED1O96006 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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ZBED1O96006 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZBED1O96006 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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