Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLGNO14967 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLGNO14967 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLGNO14967 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLGNO14967 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLGNO14967 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLGNO14967 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLGNO14967 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLGNO14967 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLGNO14967 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLGNO14967 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLGNO14967 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLGNO14967 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLGNO14967 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms