Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PTPRTO14522 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRTO14522 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRTO14522 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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